新华网上海10月1日电(史依灵)新华网从上海交通大学获悉,“长江杯”2026全球AI蛋白质设计挑战赛于近日启动。
蛋白质承担着催化、识别、信号传递等生命功能,其性能很大程度上由氨基酸序列决定。一条仅100个氨基酸组成的蛋白质,理论序列组合高达20的100次方,传统设计方法难以完成。人工智能可以从海量数据中学习序列、结构与功能规律,更快找到有潜力的候选设计。上海交通大学洪亮教授团队构建的全球最大蛋白质数据集Venus-Pod,包含数百亿条序列、几十亿个功能标签,覆盖常规生物以及马里亚纳海沟、火山口等极端环境中的耐高温、耐强压、耐强酸/强碱蛋白质,为Venus模型优化改造蛋白质提供了数据基础。
但AI计算结果并不是蛋白质设计的终点。设计出的蛋白质能否真正合成、稳定表达并实现预期功能,仍要走进实验室接受检验。据介绍,本次大赛以真实科学问题为牵引,将大规模“湿实验”验证引入赛事环节,通过统一赛题、标准化实验和真实数据评价,让来自全球不同团队、不同模型和不同技术路线的设计在同一实验体系下接受检验。
据了解,赛事设置多个蛋白质设计靶点,聚焦纳米抗体(nanobody/VHH)或迷你结合蛋白(minibinder)的从头设计。VHH分子量只有常规抗体的十分之一左右,在药物与诊断领域具有广泛应用价值;minibinder则代表从零设计蛋白质的重要方向,体现AI生成自然界不存在全新蛋白质的能力。组委会相关负责人介绍,AI完成从头设计后,组委会将对经过统一、标准化流程筛选后的不少于5000个候选蛋白免费开展实验验证,包括表达、纯化、检测,并以真实实验结果作为评价设计性能和产生优胜团队的重要依据。相关数据还将用于不同算法和模型的横向比较、持续迭代以及AI蛋白质设计基准测试建设,探索从AI设计走向自动化实验验证的科研路径。
大赛面向全球高校、科研院所、企业及跨学科创新团队开放,鼓励人工智能、计算生物学、结构生物学、蛋白质工程等不同领域科研人员跨学科协作,并设置总额100万元人民币的赛事奖金。大赛组委会相关负责人表示,希望通过开放竞赛汇聚全球AI for Science创新力量,让更多算法真正走进实验室,也让真实实验数据重新进入模型研究与方法迭代。
据悉,大赛在上海市经济和信息化委员会、上海市科学技术委员会指导下,由上海交通大学、上海人工智能实验室、临港实验室、昌平实验室、香港中文大学、浙江大学、上海科学智能研究院、未来启点社区共同发起并主办,上海交通大学自然科学研究院承办,北京大学化学与分子工程学院、清华大学化学工程系、中国科学技术大学生命科学与医学部、复旦大学智能复杂体系实验室、西湖大学工学院、国家超级计算广州中心、上海仪电集团、科学智能战略科技力量联盟协办。(完)

